全日本モトクロスは、国内最上級のモトクロス選手権で、主催は日本モーターサイクルスポーツ協会（MFJ）、正式名称は「全日本モトクロス選手権」です。全日本モトクロス選手権大会特別規則と、各大会の特別規則に基づいて開催されます。
日本モトクロスのシリーズ戦は、1967年から開始されました。世界選手権や、AMAモトクロスと同様のルールで競技されますが、４大メーカーの本拠地ということで、世界的にも最新鋭のモデルの走りを目の当たりに見ることができます。
2007年現在の開催クラスは、IA（国際A級）1（250cc）、IA（国際A級）2（125cc）、IB（国際B級）OPEN
、IB（国際B級）2（125cc）、それにレディス（85cc）の５クラスがあります。この名称は、2005年からの新名称があります。 それぞれクラス別にレースを行い、各クラスでチャンピオンが誕生します。チャンピオンの決定方法は、各大会で優勝者から順に25、22、20、18、16、15、以下1ポイントまで、20位のライダーにまでポイントが与えられ、年間合計で最多ポイントを獲得したライダーが、チャンピオンとなります。
IB2、IBOPEN 、レディスクラスは、全10戦中６戦の有効ポイント制となっています。これは、全10戦開催のうち、上位６戦のポイントのみを有効とするものであります。
出場できる最低年齢は、125cc（２ストローク100～125cc以下、４ストローク175～250cc以下の排気量の車両）は15歳、250cc（２ストローク175～250cc以下、４ストローク290～450cc以下の排気量の車両）は16歳となっています。
全日本モトクロスは、土～日曜日に競技会が開催されます。レースウイークの月～木曜日は、スポーツ走行は開催されてもよいですが、占有走行は禁止されています。金曜日は、スポーツ走行も含め、走行はすべて禁止されています。
競技会開催日の、一般的なタイムスケジュールとしては、まず、土曜日の早朝に受付と車検が行われます。午前中にライターズブリーフィングと、各クラス別の公式練習が行われ、そのあと、午後にかけて公式予選があります。予選は、クラス別に行われ、参加人数の多いクラスは、２～４組ほどに分かれて行われます。IA1とIA2は、各10分＋１周、IBOPENとIB2、及びレディスクラスは、各４周で行われます。
日曜日は決勝日で、まず早朝から公式練習があります。その後、決勝レースが行われます。決勝レースは、IA1とIA2は２ヒート制なので、午前中に１ヒート、午後１ヒートが開催されるようになっています。各レースの後には、表彰台にて、仮表彰が行われます。
なお、併催レースがある場合は、各予定の間に、公式練習、決勝レースが行われます。
全日本モトクロスのチケットは、２日間通し券で、金額は、前売り大人2,000～3,000円となっています。小学生以下（一部大会は、中学生以下）は、無料です。当日券は、前売りの500円～1,000円増しで、MFJライセンスを提示すれば、本人のみ当日券が500円引きになる会場もあります。また、前売り3,000円の大会は、公式プログラムつきの値段です。
スポーツランドSUGOでの大会は、大人シングル券のほか、ペア券と４名までのグループ券も発売されます。ペア券ならシングルより10パーセント、グループ券なら15パーセントほど安くなります。
駐車料金が、別途かかる会場もある。料金は１区画500円～1,000円で、駐車券の前売りはない場合が多いです。
チケット販売は、チケットぴあ、ファミリーマート、サークルＫサンクス、ローソンなどの、オンライン端末設置店で取り扱っています。また、MFJネットワークショップや、主要二輪販売店、主要モトクロスコースでも取り扱っていることがあります。